Понад десяток дослідницьких груп з усього світу почали аналізувати стічні води на новий коронавірус для оцінки загальної кількості заражень у тій чи іншій спільноті, враховуючи, що більшість людей не будуть проходити тестування. Науковці зазначають, що цей метод також може бути використано для виявлення коронавірусу у випадку його повернення. На даний момент дослідники знайшли сліди коронавірусу у Нідерландах, Сполучених Штатах та Швеції.
Цю статтю було вперше опубліковано Nature 3 квітня 2020 року за посиланням. Переклад на українську мову – VoxUkraine. Перепублікацію повної версії тексту заборонено.
Аналіз стічних вод – використанної води, що проходить з водосточної системи до переробляючого виробництва – один зі способів, завдяки якому дослідники можуть відслідковувати інфекційні захворювання, які виводяться з сечею чи фекаліямі, такі як SARS-CoV-2.
Одна очисна споруда може зібрати стічні води від більш ніж одного мільйона людей, каже Гертян Медема – мікробіолог з Інституту досліджень води KWR, що розташований у Ньювегейні, Нідерланди. Відслідковування впливу в цьому масштабі може надати кращі оцінки того, наскільки розповсюджений коронавірус, ніж тестування, оскільки спостереження за стічними водами може розраховувати на тих людей, які не проходили тестування і мають лише легкі симптоми, або не мають їх взагалі, каже Медема. Науковець виявив генетичний матеріал SARS-CoV-2 – вірусну РНК – на декількох очисних спорудах у Нідерландах. «Органи охорони здоров’я бачать лише верхівку айсбергу».
Але за словами дослідників, для кількісної оцінки масштабів зараження у популяції за пробами стічних вод, групам необхідно буде з’ясувати, скільки вірусної РНК виділяється з фекаліями та екстраполювати кількість інфікованих людей у популяції за концентрацієї вірусної РНК у зразках стічних вод.
Дослідники також повинні переконатися у тому, що вони розглядають репрезентативний зразок того, що виділяється населенням, а не лише вибіркові зразки, а також у тому, що їхні тести можуть виявити вірус на низьких рівнях концентрації РНК, кажуть вчені Квінслендського альянсу з гігієни довкілля в Австралії – дослідницьокго центру, який надає консультації уряду штату щодо ризиків, що стосуються гігієни навколишнього середовища.
За словами Кайла Біббі – інженера з екологічних питань університету Нотр-Дам у штаті Індіана, деякі роботи зі спостереження за вірусом були призупинені через закриття університетів і лабораторій, а також через обмежений доступ до реагентів для проведення тестів. Такі самі реагенти використовуються у лікарнях. «Ми не хочемо вносити вклад у глобальний дефіцит», – заявив він.
Ранній попереджувальний знак
Заходи щодо контролю за інфекцією, такі як соціальне дистанціювання, напевно, дозволять перемогти цю пандемію, однак вірус може повернутися, щойно ці заходи скасують. Планове спостереження за стічними водами можна використовувати як неінвазивний інструмент для раннього попередження, щоб сповіщати спільноти щодо нових захворювань на COVID-19, каже Ана Марія де Рода Хусман – дослідник інфекційних захворювань нідерландського Національного інституту громадського здоров’я та навколишнього середовища у Більтховені. Раніше інститут проводив моніторинг стічних вод для виявлення спалахів норовірусу, стійких до антибіотиків бактерій, поліовірусу та кору.
Група де Роди Гусман виявила сліди SARS-CoV-2 у стічних водах аеропорту «Сгіпхол» у Тілбурзі лише через чотири дні після того, як Нідерланди підтвердили перший випадок COVID-19 за допомогою клінічного тестування. Наразі дослідники планують дослідити стічні води в усіх 12 провінціях Нідерландів і у 12 інших містах, в яких не було підтверджено жодного випадку захворювання. Група Медеми виявила вірусну РНК у місті Амерсфурт до того, як там було підтверджено перше зараження.
Дослідження також продемонстрували, що слід SARS-CoV-2 може з’явитися у фекаліях протягом трьох днів після зараження, що набагато швидше за час, який витрачається на розвиток достатньо серйозних симптомів (до двох тижнів), щоб людина могла звернутися до лікарні та отримати офіційний діагноз, заявляє Тамар Кон – екологічний вірусолог Швейцарського федерального технологічного інституту в Лозанні. За її словами, відслідковування вірусних часток у стічних водах може надати перевагу чиновникам з охорони здоров’я під час вирішення питання щодо необхідності ведення таких заходів, як режим ізоляції. «Зволікання у сім-десять днів може мати серйозний вплив на тяжкість цієї епідемії».
Раннє виявлення вірусу у спільнотах може зменшити шкідливі наслідки від COVID-19 для сфер охорони здоров’я та економіки, особливо якщо вірус повернеться наступного року, каже Біббі.
Моніторинг стічних вод використовується десятиліттям для оцінки успішності кампаній з вакцинації для протидії поліовірусу, каже Чарльз Герба – екологічний мікробіолог з Університету Арізони в Тусоні. Цей підхід також можна використовувати для вимірювання ефективності таких заходів, як соціальне дистанціювання, каже Герба, який виявив сліди SARS-CoV-2 у неочищених стічних водах у Тусоні.
Застереження
Автори не є співробітниками, не консультують, не володіють акціями та не отримують фінансування від жодної компанії чи організації, яка б мала користь від цієї статті, а також жодним чином з ними не пов’язаний
